Croatia Airlines nutzt das leistungsstärkste Vielfliegerprogramm Europas: Miles & More. Meilen können durch die Teilnehmer beim Fliegen, Reisen oder Shoppen gesammelt werden. Eingetauscht werden können sie gegen Flugprämien, Hotelübernachtungen und Mietwagenreservierungen. Hilfebedürftige Personen werden bei rechtzeitiger Reservierung umfassend betreut. Sondermahlzeiten können bis 24 Stunden vor dem Abflugtermin bestellt werden. 1992 musste die Linienfluggesellschaft den Flugbetrieb aufgrund des Balkankrieges komplett einstellen. Bereits 1994 beförderte Croatia Airlines aber schon wieder über eine Million Passagiere.